Szóján előforduló Phoma-szerű gombák filogenetikai vizsgálata

Irinyi, László Miklós and Kövics, György and Karaffa, Erzsébet Mónika (2007) Szóján előforduló Phoma-szerű gombák filogenetikai vizsgálata. In: 12. Tiszántúli Növényvédelmi Fórum. Debreceni Egyetem Agrártudományi Centrum, Debrecen, pp. 107-127. ISBN 978-963-9732-21-6

Preview

Text 1231601.pdf Download (736kB) | Preview

Abstract

Vizsgálataink során a szóján (Glycine max) előforduló Phoma-szerű gombák molekuláris taxonómiai vizsgálatát végeztük el genetikai markerek szekvenciáinak elemezésével. A szóján előforduló, szimptomatológiai és morfológiai hasonlóságuk miatt egymástól alig megkülönböztethető Phomaszerű fajok (Phoma pinodella, Phoma sojicola, Phyllosticta sojicola, Phoma exigua var. exigua) taxonómiája terén a mai napig nagy a bizonytalanság. Vizsgálatainkhoz olyan filogenetikai markert kerestünk, amely már megbízhatónak bizonyult mind a fajok közötti, mind a fajon belüli csoportok elkülönítésére más gombataxonoknál. Ezek közül választásunk az élővilágban erősen konzervatív, transzlációs elongációs faktort kódoló génre (tef1) esett, melynek intron régiója, az rDNS-ben található (Internal Transcribed Spacer=ITS) szekvenciák mellett az egyik leggyakrabban alkalmazott alternatív filogenetikai marker. Vizsgálatainkban a Debreceni Egyetem Növényvédelmi Tanszékén található törzsgyűjteményből 11 Phoma faj 24 izolátumát, köztük a szóján előforduló három faj hét izolátumát vizsgáltuk. Először minden egyes fajt morfológiai és élettani jellegzetességeik alapján azonosítottunk, majd elvégeztük a molekuláris vizsgálatokat. Mind az ITS, mind tef1 régiók parsimony típusú filogenetikai elemzése során azt az eredményt kaptuk, hogy az eredetileg Phyllosticta sojicola-ként deponált izolátum a Phoma exigua var. exigua csoportba, a Phoma sojicola pedig a Phoma pinodella csoportba rendeződött.

Actions (login required)

Edit Item