REAL

Biomolekulák szerkezetének és kölcsönhatásainak vizsgálata informatikai és tömegspektrometriai módszerek együttes alkalmazásával = Structure and interaction of biomolecules studied by a combined application of mass spectrometry and informatics

Vékey, Károly and Drahos, László and Jakab, Annamária and Pollreisz, Ferenc (2011) Biomolekulák szerkezetének és kölcsönhatásainak vizsgálata informatikai és tömegspektrometriai módszerek együttes alkalmazásával = Structure and interaction of biomolecules studied by a combined application of mass spectrometry and informatics. Project Report. OTKA.

[img]
Preview
PDF
62727_ZJ1.pdf

Download (198kB) | Preview

Abstract

A kutatás legfontosabb eredménye peptidek, glikopeptidek és fehérjék tömegspektrometriás viselkedésének tapasztalati és elméleti leírása. Ezen eredmények alapján olyan, nemzetközi összehasonlításban is sikeres módszereket és szoftvereket fejlesztettünk ki, mely a szerkezetkutatás lehetőségeit és a tömegspektrometria alkalmazhatóságát jelentősen bővítik. Meghatároztuk az ütközési energia optimális értéke és a molekulatömeg közötti összefüggést; mely elősegíti a kísérletek automatizálását. Sikeresen leírtuk peptidek és glikopeptidek fragmentációjának szabályait, mely a spektrumok automatikus értelmezésének alapjául szolgál. Ezen eredményeink alapján olyan szoftvert dolgoztunk ki, mely lehetővé teszi a glikoziláció mintázatának meghatározását, ill. amely ezt a rendkívül munkaigényes értékelést automatizálja. Alapkutatási eredményeinket felhasználtuk a glikozilációs mintázat meghatározására, valamint kapcsolatot mutattunk ki egyes betegségek és fehérjék glikozilációja között. | The most significant result of the research project is experimental and theoretical description of the mass spectrometric behaviour of peptides, glycopeptides and proteins. Based on these results we have introduced successful new methodologies and software tools to improve applicability of mass spectrometry for structure analysis and for proteomics. A correlation between the optimal collision energy and molecular mass has been established; which facilitates the design of automatic operation protocols for mass spectrometry. Fragmentation behaviour of peptides and glycopeptides has been described; which is the basis of automatic spectra evaluation. Based on these results a new algorithm and software have been developed, which allows automatic determination of glycosylation patterns. This can substitute the very time consuming manual interpretation; which has been a major obstacle for studying glycosylation. The results described above have been used to determine glycosylation patterns and to observe correlations between protein glycosylation and various illnesses.

Item Type: Monograph (Project Report)
Uncontrolled Keywords: Analitikai Kémia
Subjects: Q Science / természettudomány > QD Chemistry / kémia > QD01 Analytical chemistry / analitikai kémia
Depositing User: Kotegelt Import
Date Deposited: 01 May 2014 05:56
Last Modified: 28 Jul 2014 11:49
URI: http://real.mtak.hu/id/eprint/11778

Actions (login required)

Edit Item Edit Item