Cseke, Klára and Köbölkuti, Zoltán Attila and Benke, Attila and Rumi, Andrea and Báder, Mátyás and Borovics, Attila and Németh, Róbert (2020) Nemesnyár klónok faanyagtani jellemzőkhöz köthető génjeinek genetikai változatossága = Allelic variation in candidate genes associated with wood properties of cultivated poplars. ERDÉSZETTUDOMÁNYI KÖZLEMÉNYEK, 10 (1). pp. 5-16. ISSN 2062-6711
|
Text
2020-001.pdf Download (407kB) | Preview |
Abstract
A nemesnyárak kiemelkedő gazdasági jelentőséggel bírnak. A bemutatott vizsgálat legfőbb célja egy olyan kutatási metodika ismertetése, amely a faanyag tulajdonságaiért felelős kulcsenzimek kódoló régióinak azonosításából indul ki, bemutatva a genomikai alapokra helyezett nemesítési technológiákban rejlő lehetőségeket. A vizsgálatunk első szakaszában 24 különböző, a faanyagképződés szempontjából releváns enzim kódoló régiójára terveztünk primerpárokat. Összesen 55 saját fejlesztésű primerpárt teszteltünk, 47,27%-os sikerességgel. Ezután nyolc enzimet választottunk ki részletesebb elemzésre hét nyárfaj és 11 hibrid klón bevonásával, összesen 23 nyár genotípus vizsgálata révén. A kiválasztott enzimek egy része a lignifikáció folyamatában vesz részt (COMT, CCoAOMT, SAMS), egy másik csoport a K+-függő xylogenezis során tölt be kulcsszerepet (Kt, ptk2, SKOR), míg a harmadik csoport (endo-1,4-b-xylanase, Araf-ase) a mikrofibrilla szög alakulásához köthető. A sikeresen amplifikált és azonosított 13 markerrégió révén összesen 188 szekvenciát elemeztünk és 90 SNP-t azonosítottunk. Értékeltük a polimorf helyek számát, a nukleotid diverzitást, az inszerciók/deléciók számát, az SNP-k típusát, a rekombinációs események minimális számát, illetve azonosítottuk a konzervatív szakaszokat. Eredményeink bemutatása során részletesen tárgyaljuk a vizsgálatban rejlő alkalmazási lehetőségeket.
Item Type: | Article |
---|---|
Uncontrolled Keywords: | SNP marker, nyár, faanyagtani jellemzők, Populus, genetikai változatosság; |
Subjects: | S Agriculture / mezőgazdaság > SD Forestry / erdőgazdaság |
SWORD Depositor: | MTMT SWORD |
Depositing User: | MTMT SWORD |
Date Deposited: | 22 Mar 2021 10:17 |
Last Modified: | 31 Mar 2023 07:34 |
URI: | http://real.mtak.hu/id/eprint/122688 |
Actions (login required)
Edit Item |