REAL

Nemesnyár klónok faanyagtani jellemzőkhöz köthető génjeinek genetikai változatossága = Allelic variation in candidate genes associated with wood properties of cultivated poplars

Cseke, Klára and Köbölkuti, Zoltán Attila and Benke, Attila and Rumi, Andrea and Báder, Mátyás and Borovics, Attila and Németh, Róbert (2020) Nemesnyár klónok faanyagtani jellemzőkhöz köthető génjeinek genetikai változatossága = Allelic variation in candidate genes associated with wood properties of cultivated poplars. ERDÉSZETTUDOMÁNYI KÖZLEMÉNYEK, 10 (1). pp. 5-16. ISSN 2062-6711

[img]
Preview
Text
2020-001.pdf

Download (407kB) | Preview

Abstract

A nemesnyárak kiemelkedő gazdasági jelentőséggel bírnak. A bemutatott vizsgálat legfőbb célja egy olyan kutatási metodika ismertetése, amely a faanyag tulajdonságaiért felelős kulcsenzimek kódoló régióinak azonosításából indul ki, bemutatva a genomikai alapokra helyezett nemesítési technológiákban rejlő lehetőségeket. A vizsgálatunk első szakaszában 24 különböző, a faanyagképződés szempontjából releváns enzim kódoló régiójára terveztünk primerpárokat. Összesen 55 saját fejlesztésű primerpárt teszteltünk, 47,27%-os sikerességgel. Ezután nyolc enzimet választottunk ki részletesebb elemzésre hét nyárfaj és 11 hibrid klón bevonásával, összesen 23 nyár genotípus vizsgálata révén. A kiválasztott enzimek egy része a lignifikáció folyamatában vesz részt (COMT, CCoAOMT, SAMS), egy másik csoport a K+-függő xylogenezis során tölt be kulcsszerepet (Kt, ptk2, SKOR), míg a harmadik csoport (endo-1,4-b-xylanase, Araf-ase) a mikrofibrilla szög alakulásához köthető. A sikeresen amplifikált és azonosított 13 markerrégió révén összesen 188 szekvenciát elemeztünk és 90 SNP-t azonosítottunk. Értékeltük a polimorf helyek számát, a nukleotid diverzitást, az inszerciók/deléciók számát, az SNP-k típusát, a rekombinációs események minimális számát, illetve azonosítottuk a konzervatív szakaszokat. Eredményeink bemutatása során részletesen tárgyaljuk a vizsgálatban rejlő alkalmazási lehetőségeket.

Item Type: Article
Uncontrolled Keywords: SNP marker, nyár, faanyagtani jellemzők, Populus, genetikai változatosság;
Subjects: S Agriculture / mezőgazdaság > SD Forestry / erdőgazdaság
SWORD Depositor: MTMT SWORD
Depositing User: MTMT SWORD
Date Deposited: 22 Mar 2021 10:17
Last Modified: 31 Mar 2023 07:34
URI: http://real.mtak.hu/id/eprint/122688

Actions (login required)

Edit Item Edit Item