Repository of the Academy's Library

Szerkezeti változások monomerektől a biopolimerek felé = Structural changes from monomers to biopolymers

Hargittai, István and Horváth, Viktória and Izvekov, Vladiszlav and Kovács, Attila (2009) Szerkezeti változások monomerektől a biopolimerek felé = Structural changes from monomers to biopolymers. Project Report. OTKA.

[img]
Preview
PDF
46183_ZJ1.pdf

Download (78Kb)

Abstract

Kutatásaink fő célja kémiai-biológiai frontvonalbeli jelentőségű peptidek és szénhidrátok szerkezeti jellemzőinek felderítése volt, fokozott figyelemmel a szerkezeti jellemzők alakulására a biomolekulák méretének növekedésével. Homo-oligopeptidek kvantumkémiai vizsgálatával kimutattuk a távolható kölcsönhatások stabilizáló szerepét és mértékét a másodlagos szerkezetekben, és meghatároztuk azokat a geometriai paramétereket, amelyek ezen kölcsönhatások jelzésére/mérésére alkalmasak. A prionfehérje 115-122 szegmensének konformációs analízisével igazoltuk ezen szegmens hajlamát béta-redős szerkezet kialakítására vizes oldatban. Felderítettük a hialuronan kisebb szacharid egységeinek (D-glükuronsav, N-acetil-D-glükózamin és a belőlük származtatható diszacharidok) konformációs tulajdonságait a gázfázis és a vizes oldat kvantumkémiai modellezésével. Kísérleti és elméleti módszerek kombinált alkalmazásával elvégeztük a fenti monoszacharidok teljes rezgési analízisét szilárd fázisú FT-IR spektrumaik alapján. Részben analóg módon, de a kifagyasztott gázfázisról készített FT-IR spektrumok alapján határoztuk meg a glükóz teljes rezgési erőterét és a gázfázisban uralkodó konformációs egyensúly jellemzőit. Kisebb biológiai jelentőséggel bíró vegyületeken végzett szerkezeti vizsgálatokkal együtt a pályázat anyagi támogatásával 19 tudományos közlemény és 2 könyvfejezet készült. | The main goal of our project was the determination of structural characteristics of peptides and carbohydrates of frontier chemical-biological importance. We paid particular attention to the variation of the structural properties with increasing model size. Our quantum chemical calculations on homooligopeptides showed the importance and magnitude of long-range interactions on the stabilization of the secondary structures and determined the geometrical parameters of marker character. On the basis of a conformational analysis of the 115-122 segment of prion protein we interpreted the propensity for beta-sheet formation of secondary structures in aqueous solutions. We elucidated the conformational properties of the building-blocks of hyaluronan (D-glucuronic acid, N-acetyl-D-glucosamine and disaccharides formed from them) by means of quantum chemical modeling of the gaseous phase and aqueous solution. We performed a complete vibrational analysis of the monosaccharides on the basis of their solid-phase FT-IR spectra jointly applying experimental and theoretical methods,. Using in part an analogous approach, we determined the full vibrational force field of glucose and the character of its gas-phase conformational equilibrium on the basis of FT-IR spectra of the frozen vapor,. These works augmented with structural studies of compounds of lesser biological importance resulted in 19 research papers and 2 book chapters with the financial support from the present OTKA grant.

Item Type: Monograph (Project Report)
Uncontrolled Keywords: Fizikai-Kémia és Szervetlen Kémia, molekulageometria
Subjects: Q Science / természettudomány > QD Chemistry / kémia > QD01 Analytical chemistry / analitikai kémia
Depositing User: Mr. Andras Holl
Date Deposited: 08 May 2009 11:00
Last Modified: 30 Nov 2010 18:34
URI: http://real.mtak.hu/id/eprint/1323

Actions (login required)

View Item View Item