REAL

Égerpatogén Phytophthora-fajhibridek mitokondriális genomjainak tanulmányozása = Study of mitochondrial genoms of hybrid alder Phytophtoras

Bakonyi, József and Érsek, Tibor and Nagy, Zoltán (2008) Égerpatogén Phytophthora-fajhibridek mitokondriális genomjainak tanulmányozása = Study of mitochondrial genoms of hybrid alder Phytophtoras. Project Report. OTKA.

[img]
Preview
PDF
46228_ZJ1.pdf

Download (231Kb)

Abstract

A kutatás a fitoftórás égervész kórokozójával, a P. alnival foglalkozik. E kórokozó izolátumait 3 klónszerű alfajba sorolják. A P. alni szülőfajai feltehetően az égerre nem patogén P. cambivora és a P. fragariae. Célunk a hibridek és feltételezett szülőfajaik genetikai változékonyságának tanulmányozása volt. Kifejlesztettünk egy olyan DNS-re alapozott eljárást, mellyel a P. alni alfajai kétséget kizáró módon elkülöníthetők egymástól és a feltételezett szülőfajoktól. A módszer alkalmas a hibridek fertőzött növényi mintákban való kimutatására. A mitokondriális (mt)DNS-t tekintve 41 P. cambivora izolátum tizenhét, 19 P. fragariae izolátum négy, 25 P. alni törzs pedig két haplotípust tartalmazott. Nem találtunk a hibridekben és bármelyik szülőfajban közös haplotípust. Régiók szerinti tagozódást sem figyeltünk meg. A P. fragariae szamócáról és málnáról származó tenyészetei viszont egyértelműen elkülönültek. A P. alni ssp. alni kétféle mintázatot tartalmazott. Egyik az egyöntetű P. alni ssp. multiformisban, a másik pedig a szintén egyöntetű P. alni ssp. uniformisban is előfordult. Ez egy olyan genetikai kölcsönhatásra utal, melynek következtében egyes törzsek ssp. alni típusú sejtmagot és ssp. uniformis, vagy ssp. multiformis típusú mitokondriumot örököltek. Különböző mtDNS-típusok jelenléte a hibridekben azt sejteti, hogy nem csak egy-egy szülőizolátum között zajlott le a hibridizációs esemény. Adataink segítik a hibridek kialakulásának megismerését. | The research focuses on Phytophthora alni, the causal agent of alder decline, of which isolates are classified into three clonal subspecies. The putative parental species of P. alni are P. cambivora and P. fragariae, which are not pathogens of alder. Our aim was to study the genetic variability of P. alni and their parental species. We have developed a DNA-based assay that unambiguously differentiates amongst the three subspecies of P. alni and the putative parents. The assay is suitable for detecting the causal agent in the infested plant. Regarding the mitochondrial (mt)DNA, 41 P. cambivora, 19 P. fragariae and 25 P. alni strains contained seventeen, four and two mtDNA haplotypes, respectively. No common haplotype was found in the hybrids and any of the putative parents. Geographical sub-structuring was neither observed. Isolates of P. fragariae were clearly separated according to their hosts (strawberry vs. raspberry). P. alni ssp. alni possessed two types of mtDNA, one also present in the monomorphic P. alni ssp. multiformis, and another one present in P. alni ssp. uniformis. This suggests that certain hybrid strains received ssp. alni-type nucleus but ssp. uniformis-type or ssp. multiformis-type mitochondria. The presence of different mtDNA-types in the hybrids indicates that not only two parental isolates took part in the formation of P. alni hybrids. The data help to understand the evolution of P. alni.

Item Type: Monograph (Project Report)
Uncontrolled Keywords: Növényvédelem
Subjects: S Agriculture / mezőgazdaság > SB Plant culture / növénytermesztés
Depositing User: Mr. Andras Holl
Date Deposited: 08 May 2009 11:00
Last Modified: 30 Nov 2010 18:28
URI: http://real.mtak.hu/id/eprint/1344

Actions (login required)

View Item View Item