Egyszerűsített, alacsony költségű génexpressziós teszt az emlődaganatos betegségek kimenetelének előrejelzésére rutin patológiai blokkok felhasználásával | Prediction of the prognosis of breast cancer in routine histologic specimens using a simplified, low-cost gene expression signature

Szász, A. Marcell and Ács, Balázs and Ágoston, Emese and Sztupinszki, Zsófia and Tőkés, Anna-Mária and Szittya, Liliána and Székely, Borbála and Szendrői, Miklós and Li, Qiyuan and Harsányi, László and Tímár, József and Szállási, Zoltán and Swanton, Charles and Győrffy, Balázs and Kulka, Janina (2013) Egyszerűsített, alacsony költségű génexpressziós teszt az emlődaganatos betegségek kimenetelének előrejelzésére rutin patológiai blokkok felhasználásával | Prediction of the prognosis of breast cancer in routine histologic specimens using a simplified, low-cost gene expression signature. Orvosi Hetilap, 154 (16). pp. 627-632. ISSN 0030-6002

Text oh.2013.29590.pdf Restricted to Repository staff only until 30 April 2033. Download (278kB)

Abstract

Bevezetés: Közepesen differenciált (grade 2) tumorok esetén a beteg prognózisa és a terápia eredményessége e tényező alapján nem becsülhető meg biztonsággal. Célkitűzés: Vizsgálni a szerzők által leírt, kromoszomális instabilitást tükröző prognosztikus génexpressziós indexet kiegészítve további génekkel egy kiterjesztett betegcsoporton. Módszerek: Publikus adatbázisokból választottak ki kilenc cél-, valamint három kontrollgént. Ezek expresszióját valós idejű polimeráz láncreakcióval határozták meg. Az analízisben 249, formalinban fixált, paraffinba ágyazott emlőcarcinoma vizsgálatát végezték el és az eredményeiket a betegségmentes túléléssel összefüggésben elemezték. Eredmények: A gének expressziójának mértéke alapján a grade 2 carcinomák a grade 1, illetve a grade 3 tumorokhoz hasonló prognózisú csoportokra különültek el. Pusztán a FOXM1, TOP2A és CLDN4 gének együttes vizsgálatával a grade 2 daganatok magas és alacsony kockázatú alcsoportokba oszthatóak. Következtetés: Megfelelően választott kontrollgének vizsgálatával három célgén expressziója alapján a hisztológiai grade-től függetlenül elkülöníthető az emlőcarcinomák jó és rossz prognózisú csoportja. Orv. Hetil., 2013, 154, 627–632. | Background: Grade 2 breast carcinomas do not form a uniform prognostic group. Aim: To extend the number of patients and the investigated genes of a previously identified prognostic signature described by the authors that reflect chromosomal instability in order to refine characterization of grade 2 breast cancers and identify driver genes. Methods: Using publicly available databases, the authors selected 9 target and 3 housekeeping genes that are capable to divide grade 2 breast carcinomas into prognostic groups. Gene expression was investigated by polymerase chain reaction in 249 formalin-fixed, paraffin-embedded breast tumors. The results were correlated with relapse-free survival. Results: Histologically grade 2 carcinomas were split into good and a poor prognosis groups. Centroid-based ranking showed that 3 genes, FOXM1, TOP2A and CLDN4 were able to separate the good and poor prognostic groups of grade 2 breast carcinomas. Conclusion: Using appropriately selected control genes, a limited set of genes is able to split prognostic groups of breast carcinomas independently from their grade. Orv. Hetil., 2013, 154, 627–632.

Actions (login required)

Edit Item