Az 5q31 IBD5-régióban található IGR és SLC22A4/SLC22A5 variánsok lehetséges szerepe a gyulladásos bélbetegség kialakulásában = Possible role of selected IGR and SLC22A4/SLC22A5 loci in development of inflammatory bowel diseases

Lakner, Lilla and Csöngei, Veronika and Magyari, Lili and Varga, Márta and Miheller, Pál and Sarlós, Patrícia and Orosz, Péter and Bári, Zsolt and Takács, István and Járomi, Luca and Sáfrány, Enikő and Sipeky, Csilla and Bene, Judit and Tulassay, Zsolt and Döbrönte, Zoltán and Melegh, Béla (2009) Az 5q31 IBD5-régióban található IGR és SLC22A4/SLC22A5 variánsok lehetséges szerepe a gyulladásos bélbetegség kialakulásában = Possible role of selected IGR and SLC22A4/SLC22A5 loci in development of inflammatory bowel diseases. Orvosi Hetilap, 150 (29). pp. 1375-1380. ISSN 0030-6002

Preview

Text oh.2009.28677.pdf Download (117kB) | Preview

Abstract

Az idiopathiás krónikus gyulladásos bélbetegség kialakulásában környezeti tényezők, immunológiai és genetikai faktorok egyaránt szerepet játszanak. Az utóbbi években a CARD15 gén mellett egyre több adat támasztja alá más gének, többek között az 5q31-33 régióban elhelyezkedő IBD5 locus (MIM#606348) szerepét. Egyes tanulmányok ezen régióban az SLC22A4 gén C1672T szubsztitúciójának, illetve az SLC22A5 gén G-207C transzverziójának együttes szerepét hangsúlyozzák, különösen Crohn-betegség kialakulásában, míg más szerzők új minor hajlamosító tényezőket azonosítottak az IBD5 kromoszómarégióban, ezek az IGR-variánsok. Célkitűzés: Az SLC22A4 C1672T és SLC22A5 G-207C mutációk mellett az IGR2096a_1 (rs12521868) és az IGR2198a_1 (rs11739135) polimorfizmusok szerepének vizsgálata gyulladásos bélbetegség kialakulásában. Betegek és módszer: Vizsgálatunk során 440 gyulladásos bélbeteg (206 Crohn- és 234 colitis ulcerosás beteg), valamint 279 kontrollegyén perifériás vérmintájából PCR-RFLP technikával végeztünk DNS-analízist. Eredmények: Sem a C1672T, sem a G-207C allélek, sem a TC haplotípus nem bizonyult rizikófaktornak sem Crohn-betegség, sem colitis ulcerosa esetében. Ezzel ellentétben mindkét minor IGR allél frekvenciája: mind az IGR2096a_1 T (48,1%), mind az IGR2198a_1 C (46,1%) szignifikánsan magasabb volt Crohn-betegségben a kontrollokéhoz (38,5%, 38,4%) képest (p<0,05). Korra és nemre standardizált regressziós analízissel mindkét allélnél fokozott rizikót észleltünk Crohn-betegség vonatkozásában (T-allél: OR=1,694, 95%-os CI: 1,137–2,522, p=0,010, C-allél: OR=1,644, 95%-os CI=1,103–2,449, p=0,015). Colitis ulcerosa esetén nem találtunk összefüggést a két IGR-variáns és a betegség kialakulása között. Következtetés: az IGR minor alléleknek a környező kaukázusi népcsoportoktól eltérően magyarországi populációban szerepük lehet a Crohn-betegség kialakulásában. | The IBD5 locus (MIM#606348) on chromosome 5q31 has been demonstrated to confer increased risk for inflammatory bowel disease. Controversial reports have been published about the significance of individual loci located in this region. Here we investigated the possible genetic association of inflammatory bowel diseases with C1672T of SLC22A4 and G-207C SLC22A5 alleles, and with IGR2096a_1 (rs12521868) and IGR2198a_1 (rs11739135) susceptibility variants of the IBD5 region located on chromosome 5q31. Patients and methods: Total of 440 patients, 206 with Crohn’s disease, 234 with ulcerative colitis, and 279 controls were studied by PCR-RFLP methods. Results: Neither the C1672T, and G-207C alleles, nor the TC haplotype were found to confer risk for Crohn’s disease or ulcerative colitis. By contrast, both of the minor allele frequencies of IGR2096a_1 T (48.1%) and IGR2198a_1 C (46.1%) were increased in Crohn’s disease subjects as compared with the controls (38.5% and 38.4%, respectively; p<0.05). Using regression analysis adjusted to age and gender these alleles were found to confer risk for Crohn’s disease (OR=1.694, 95% CI: 1.137–2.522; p=0.010 for T allele, OR=1.644, 95% CI=1.103–2.449; p=0.015 for C allele of IGRs). In UC no such associations were found. Conclusions: Our results revealed the susceptibility nature of the examined IGR minor alleles in Hungarians, which nation differs historically from the surrounding Caucasian populations in origin of the founders of the state.

Actions (login required)

Edit Item