A specificitás és gátlás szerkezeti alapjai az immunrendszer néhány fontos fehérjéjében = Structural basis of specificity and inhibition in some important proteins of the immune system

Harmat, Veronika (2011) A specificitás és gátlás szerkezeti alapjai az immunrendszer néhány fontos fehérjéjében = Structural basis of specificity and inhibition in some important proteins of the immune system. Project Report. OTKA.

Preview

PDF 67937_ZJ1.pdf Download (799kB) | Preview

Abstract

A komplementrendszer kezdeti proteázainak szerkezetét és tanulmányoztuk röntgen-krisztallográfával, specificitásuk és működésük során kialakuló kölcsönhatásaik atomi szintű jellemzése céljából. A fehérje kölcsönhatásokat a fehérjék egy szélesebb körén is jellemzzük kalmodulin, prolil-oligopeptidáz és acilpeptid-hidroláz szerkezetek segítségével. A MASP-1, MASP-2 és C1r komplement fehérjék esetén a komplexálatlan, komplexált és proenzim formák szerkezetének összehasonlítása volt a célunk. Meghatároztuk a MASP-1 aktív fragmentumának szerkezetét, amelyre jellemző széles szubsztrátkötő árok összefüggésben lehet a rokon komplement fehérjéknél szélesebb specificitásával. A C1r aktív katalitikus fragmentumának szerkezete alapján felülvizsgáltuk a C1r aktivációs mechanizmusát. A MASP-2 autoaktivációs komplexében és specifikus fehérje-inhibitorral alkotott komplexének szerkezetében a szerin proteázok kanonikus enzim/termék ill. enzim/szubsztrát kölcsönhatásain kívül kiterjedt kötőrégiók találhatók. A vizsgált enzimek szűk specificitása szempontjából fontos a kötőrégió kiterjedtsége, valamint a különböző komplexek képződésekor indukált konformáció változások-az enzim szerkezetének adaptálódása. | We studied structures of the early proteases of the complementusing crystallographic methods in order to characterize their specificity and interactions at atomic level. We used calmodulin, prolyl oligopeptidase and acylpeptide hydrolase strucutres for characterizing several aspects protein interactions. We studied the uncomplexed, complexed and proenzyme forms of MASP-1, MASP-2 and C1r. We solved the structure of the active fragment of MASP-1. The wide substrate binding groove characteristic to the structure is likely to be the structural basis of its specificity being wider than that of its related complement proteases. We revisited the autoactivation mechansim of C1r autoactivation, based on the structure of its active catalytic fragment. The structures of the autoactivation complex of MASP-2 and its complex with a specific serine-protease inhibitor revealed extended contact regions beyond the canonical enzyme/product and enzyme/inhibitor interactions. The extensions of the binding region and conformational adaptation of these enzymes are likely to be major bases of their narrow specificity.

Actions (login required)

Edit Item