Alsó légúti minták molekuláris mikrobiológiai vizsgálata a koronavírus-járvány időszakában

Károlyi, Sándor and Juhász, Emese and Iván, Miklós Ábel and Szabó, Edina and Farkas, Petronella and Kristóf, Katalin (2022) Alsó légúti minták molekuláris mikrobiológiai vizsgálata a koronavírus-járvány időszakában. ORVOSI HETILAP, 163 (33). pp. 1295-1302. ISSN 0030-6002

Preview

Text 1788-6120-article-p1295.pdf Available under License Creative Commons Attribution. Download (554kB) | Preview

Abstract

Bevezetés: A BioFire FilmArray Pneumonia plus Panel (bioMérieux) az alsó légúti fertőzések mikrobiológiai diagnosztikájára kidolgozott „real-time” PCR-rendszer, mely 18 baktérium, 9 vírus és 7 antibiotikum-rezisztenciagén kimutatására képes. A két órán belül eredményt adó módszer segíti a pneumonia differenciáldiagnosztikáját, a terápiás döntéshozatalt. Célkitűzés: Laboratóriumunkban pneumonia kivizsgálása érdekében végzett PCR-paneltesztek eredményeinek átte- kintése, a hagyományos bakteriológiai feldolgozás eredményeivel való összehasonlítása. Módszerek: A 2020. október és 2021. szeptember közötti időszakban 820, feltételezetten pneumoniás kórházi beteg- től származó alsó légúti mintát vizsgáltunk a PCR-panellel. A mintákból a multiplex PCR-vizsgálat mellett tenyész- tést is végeztünk. A kiegészítő SARS-CoV-2-PCR-vizsgálatok orr-garat törletből vett mintákból történtek. Eredmények: A minták 40%-a SARS-CoV-2-pozitív betegtől származott. A minták 60%-ánál jelzett patogént vagy rezisztenciagént a PCR-panel. A három leggyakrabban kimutatott kórokozó a Pseudomonas aeruginosa, a Staphylo coccus aureus és az Acinetobacter baumannii volt. A PCR-rel detektált baktériumok 44%-a tenyésztéssel nem igazo- lódott, és viszont: tenyésztéssel számos olyan baktériumot, gombafajt, antibiotikum-rezisztenciamechanizmust iga- zoltunk, melyet a PCR-panel nem vizsgált, vagy melyre negatív eredményt adott. A SARS-CoV-2-pozitív csoportban a S. aureus adta az azonosított kórokozók 25,8%-át. A leggyakrabban kimutatott rezisztenciagén a mecA/C (MRSA) volt. A SARS-CoV-2-pozitív betegek mintáinak 2%-ában, míg a SARS-CoV-2-negatív betegek mintáinak 13%-ában mutattunk ki egyéb légúti vírusgént is. Következtetés: A kórházi pneumoniák gyakori kórokozóit PCR-vizsgálataink eredményei igazolták. A PCR-panel cél- spektrumában nem szereplő kórokozók jelentősége és az antibiotikumrezisztenciák multifaktoriális volta miatt a pneumoniaspecifikus multiplex PCR-vizsgálatokat tenyésztéssel együtt javasolt végezni, és ezek eredményét együttesen érdemes értelmezni.

Actions (login required)

Edit Item