REAL

Az érzékeny kutatási adatok megosztása a személyre szabott orvoslás gyakorlatában = Sharing sensitive research data in the practice of personalised medicine

Molnár, Viktor and Cs. Sági, Judit and Molnár, Mária Judit (2023) Az érzékeny kutatási adatok megosztása a személyre szabott orvoslás gyakorlatában = Sharing sensitive research data in the practice of personalised medicine. ORVOSI HETILAP, 164 (21). pp. 811-819. ISSN 0030-6002

[img]
Preview
Text
650-article-p811.pdf - Published Version
Available under License Creative Commons Attribution.

Download (513kB) | Preview

Abstract

Az egészségügyi és az orvosbiológiai kutatások adatainak széttagoltsága az adatvezérelt döntéseken alapuló, személyre szabott orvoslás egyik akadálya. A fejlődéshez a méretben és komplexitásban is rendkívüli, ám töredezett egészségügyi adatkincs hatékony kiaknázását, illetve az intézményeken vagy akár határokon is átívelő adatmegosztást biztosító technológiák szükségesek. A biobankok nemcsak a minták archívumai, hanem adatintegrációs központok is egyúttal. A biobankok adatainak együttműködésben történő elemzése értékesebb következtetéseket ígér. Az adatok megosztásának előfeltétele a harmonizáció, azaz a minták egyedi klinikai és molekuláris jellemzőinek egységes adatmodellben és standard kódokkal történő leképezése. Az egészségügyben keletkezett információk ezekben a közös sémára illesztett adatbázisokban válnak elérhetővé a gépi tanulás számára, így a módszer az együttműködés során a személyes adatokat tiszteletben tartó felhasználásra is lehetőséget ad. Az érzékeny egészségügyi adatok újraértékelése elképzelhetetlen a személyes adatok védelme nélkül, amelynek jogi és koncepcionális kereteit a GDPR- (General Data Protection Regulation) és a FAIR- (findable, accessible, interoperable, reusable) elvek jelölik ki. Az Európában működő biobankok számára a BBMRI-ERIC (Biobanking and Biomolecular Research Infrastructure – European Research Infrastructure Consortium) kutatási infrastruktúra fejleszt közös irányelveket, amelyhez hazánk 2021-ben mint Magyar BBMRI Csomópont csatlakozott. Első lépésben a biobankok szövetségében kapcsolódhatnak össze a széttagolt adathalmok, ahol sokrétű kutatási cél által motivált, igényesen összerendezett adatkészletek válnak hozzáférhetővé. Ezt követően, a betegellátás valós környezetében keletkezett adatok magasabb szinten történő értékelése is lehetővé válik, így a klinikai vizsgálatok szigorú keretek között generált bizonyítékai új szintre kerülhetnek. Közleményünkben a „federált” adatmegosztásban rejlő lehetőségeket mutatjuk be a Semmelweis Egyetem biobankjainak közös projektje kapcsán. | Fragmentation of health data and biomedical research data is a major obstacle for precision medicine based on data-driven decisions. The development of personalized medicine requires the efficient exploitation of health data resources that are extraordinary in size and complexity, but highly fragmented, as well as technologies that enable data sharing across institutions and even borders. Biobanks are both sample archives and data integration centers. The analysis of large biobank data warehouses in federated datasets promises to yield conclusions with higher statistical power. A prerequisite for data sharing is harmonization, i.e., the mapping of the unique clinical and molecular characteristics of samples into a unified data model and standard codes. These databases, which are aligned to a common schema, then make healthcare information available for privacy-preserving federated data sharing and learning. The re-evaluation of sensitive health data is inconceivable without the protection of privacy, the legal and conceptual framework for which is set out in the GDPR (General Data Protection Regulation) and the FAIR (findable, accessible, interoperable, reusable) principles. For biobanks in Europe, the BBMRI-ERIC (Biobanking and Biomolecular Research Infrastructure - European Research Infrastructure Consortium) research infrastructure develops common guidelines, which the Hungarian BBMRI Node joined in 2021. As the first step, a federation of biobanks can connect fragmented datasets, providing high-quality data sets motivated by multiple research goals. Extending the approach to real-word data could also allow for higher level evaluation of data generated in the real world of patient care, and thus take the evidence generated in clinical trials within a rigorous framework to a new level. In this publication, we present the potential of federated data sharing in the context of the Semmelweis University Biobanks joint project. Orv Hetil. 2023; 164(21): 811-819.

Item Type: Article
Uncontrolled Keywords: precíziós medicina, biobank, adatmegosztás, elosztott, személyes adatvédelmet biztosító eljárások | precision medicine, biobank, data sharing, privacy-preserving federated learning
Subjects: R Medicine / orvostudomány > R1 Medicine (General) / orvostudomány általában
SWORD Depositor: MTMT SWORD
Depositing User: MTMT SWORD
Date Deposited: 21 Sep 2023 07:54
Last Modified: 21 Sep 2023 07:54
URI: http://real.mtak.hu/id/eprint/174268

Actions (login required)

Edit Item Edit Item