Szintetikus és NMR kutatások peptidek és szénhidrátok körében = Synthetic and NMR studies of peptides and carbohydrates

Szilágyi, László (2007) Szintetikus és NMR kutatások peptidek és szénhidrátok körében = Synthetic and NMR studies of peptides and carbohydrates. Project Report. OTKA.

Preview

PDF 34515_ZJ1.pdf Download (145kB)

Abstract

Egy immunomoduláns peptidoglikán-monomer (PGM) lipofil származékainak konformációját 2D NMR és molekulamodellezés segítségével határoztuk meg. A szubsztituensek okozta konformáció változások a biológiai aktivitást nem befolyásolják. Bakteriális endotoxinokat (LPS) gátló LALF-14 hexadekapeptid LPS-kötődését hasonló módszerekkel vizsgálva kimutattuk, hogy a teljes LALF protein lipid-A-kötő ?-lemez régiója nem előfeltétele a LALF-14 - LPS-kötődésnek. Dodekapeptidekben NOE-mérésekkel és molekulamodellezéssel aromás gyűrű - amid-H kölcsönhatásokat mutattunk ki amelyek a helikális térszerkezettel kapcsolatosak. Új típusú, háromkötéses glikozidos hidat tartalmazó glikomimetikumok első képviselőiként glikozil-diszulfidokat és -szulfénamidokat szintetizáltunk. Hidrazino-pirimidinek és aromás aldehidek acilezési reakcióban nukleozid-analóg [1,2,4]triazolo[4,5-a]pirimidin-4-on származékokat eredményeznek. Javaslatot tettünk ezen új gyűrűzárási reakció mechanizmusára. Javasoltuk a Lipari-Szabó NMR relaxációs módszer kiterjesztését. Módszerünkkel fehérjékben meghatározható a kémiai eltolódások anizotrópiája (CSA) és az ún. geometriai faktor is. Új TROSY módszert javasoltunk az NH-H? csatolási állandók mérésére fehérjékben. Érzékeny, és pontos NMR módszereket fejlesztettünk ki gyengén orientált közegben maradék dipoláris csatolások, és diasztereotóp metilén-proton csatolások dipoláris járulékainak mérésével az új glikomimetikumok térszerkezetének jellemzésére. | 2D NMR and molecular modelling studies of lipophilic derivatives of peptidoglycan monomer (PGM) indicate that conformational changes induced by the substituents do not affect the biological activities of these compounds. Using similar approaches it was shown that binding of the LALF-14 inhibitor peptide to bacterial endotoxins (LPS) does not require the -sheet structure in the lipid-A binding region of full-size LALF protein as a prerequisite. Interactions between amide protons and side chain aromatic rings in helical dodecapeptides were identified by NOE-restrained molecular modelling. Diglycosyl disulfides and glycosyl sulfenamides were synthesized as the first representatives of novel glycomimetics with three-bond glycosidic linkages. Hydrazino-pyrimidines react with aromatic aldehydes under acylating conditions to furnish nucleoside analog [1,2,4]triazolo[4,5-a]pyrimidin-4-ones. A mechanism was proposed for these novel ring closing reactions. The Lipari-Szabó formalism for NMR relaxation data was extended for the determination of individual chemical shift anisotropies (CSA) and the geometry factors in proteins. A new TROSY sequence was developed to measure NH-H? couplings in proteins. Novel NMR methods were proposed to measure residual dipolar couplings and the dipolar contribution to the scalar coupling between diastereotopic protons in weakly aligned media. These NMR methods are of importance in the structural studies of the novel glycomimetics.

Actions (login required)

Edit Item