A sárga pigment tartalommal összefüggő molekuláris markerek azonosítása őszi durum búzában (Triticum durum Desf.) = Identification of molecular markers linked to yellow pigment content in winter durum wheat (Triticum durum Desf.)

Vida, Gyula and Puskás, Katalin and Szunics, László (2007) A sárga pigment tartalommal összefüggő molekuláris markerek azonosítása őszi durum búzában (Triticum durum Desf.) = Identification of molecular markers linked to yellow pigment content in winter durum wheat (Triticum durum Desf.). Project Report. OTKA.

Preview

PDF 38044_ZJ1.pdf Download (219kB)

Abstract

A nagy sárgapigment-tartalom a durum búza egyik legértékesebb beltartalmi tulajdonsága. A pályázat időtartama alatt célunk az őszi durum búza sárga pigment tartalmával összefüggő molekuláris markerek azonosítása volt. A sárgapigment-tartalommal szorosan korreláló sárgaindex alapján eltérő szülőkkel utódpopulációt hoztunk létre, melyből a pályázat időtartama alatt 98 kiegyenlített törzset alakítottunk ki. Ezek, valamint a szülők DNS-ét felhasználva, "bulk" szegregáns analízissel a sárgaindex tartalommal összefüggő molekuláris markereket azonosítottunk, melyhez 520 RAPD primert használtunk. Munkánk során 5 primerrel 9 polimorf markert azonosítottunk. Korrelációanalízissel megállapítottuk a markerek és a két évben mért sárgaindex átlagok kapcsoltságát. A determinációs koefficiens értéke 0 és 13% között volt, legszorosabb kapcsoltságot az OPA16-800 markerrel számítottuk. Többszörös regresszióval mind a 9 markert figyelembe véve R2=0,4205, a 4 szignifikáns markerrel R2=0,3773 volt a többszörös determinációs koefficiens értéke. Diszkriminancia analízissel ellenőriztük, hogy a sárgaindex alapján elvégzett csoportosítást mennyire támasztják alá a marker adatok. Mind a 9 markert használva a törzsek 80%-ának csoportba sorolása helyesnek bizonyult. Négy markerrel ugyanez az érték 77% volt, azonban az elemzés a kis sárgaindexű törzsek 93,47%-ának besorolását alátámasztotta, így e 4 markerrel a rossz technológiai minőségű törzsek nagy valószínűséggel azonosíthatók. | High yellow pigment content is one of the most valuable chemical traits of durum wheat. The aim of the project was to identify molecular markers linked to the yellow pigment content of winter durum wheat. A progeny population was created from parents differing for the yellow index and 98 advanced lines were developed during the course of the project. Bulk segregant analysis was carried out on the DNA of these lines and on the parental partners using 520 RAPD primers in order to identify molecular markers linked to the yellow index. Nine polymorphic markers were detected using five primers. Correlation analysis was used to determine linkage between the markers and the yellow index (mean of two years). The value of the coefficient of determination ranged from 0 to 13%, the closest linkage being calculated for marker OPA16-800. When multiple regression involved all nine markers the coefficient of multiple determination had a value of R2 = 0.4205, while this value was R2 = 0.3773 for the four significant markers. Discriminant analysis was used to check whether the marker data confirmed the groupings based on yellow index. When all nine markers were used the grouping of 80 % of the lines proved to be correct, while this figure was 77 % for the four markers. However, this latter analysis confirmed the grouping of 93.47 % of lines with low yellow index, suggesting that these four markers could be used with high accuracy to identify lines with poor technological quality.

Actions (login required)

Edit Item