Szárazságtűrésben szerepet játszó SNP-k azonosítása kocsánytalan tölgy populációkban : alapkutatási eredmények a fenntartható tölgygazdálkodásért = Identification of SNP markers responsible for drought tolerance in sessile oak populations : results of basic research for sustainable oak management

Benke, Attila and Köbölkuti, Zoltán Attila and Cseke, Klára and Borovics, Attila and Tóth, Endre György (2022) Szárazságtűrésben szerepet játszó SNP-k azonosítása kocsánytalan tölgy populációkban : alapkutatási eredmények a fenntartható tölgygazdálkodásért = Identification of SNP markers responsible for drought tolerance in sessile oak populations : results of basic research for sustainable oak management. ERDÉSZETTUDOMÁNYI KÖZLEMÉNYEK, 12 (1-2). pp. 77-90. ISSN 2062-6711

Preview

Text 2022-05.pdf - Published Version Download (2MB) | Preview

Abstract

Állományalkotó fafajaink genetikai állományban fellelhetőek az alkalmazkodási folyamatok lenyomatai, amelyek fontos ismereteket szolgáltathatnak a klímaadaptációt segítő erdőművelési stratégiák meghatározásához. Jelen kutatásunk során 18 közép- és délkelet-európai kocsánytalan tölgy [Quercus petraea (Matt.) Liebl.] populáció egyedeiben kimutatott SNP-k (egypontos nukleotid eltérések) és zárvatermő növények genomjában meghatározott, szárazságtűréssel kapcsolatba hozható szekvenciák kocsányos tölgy (Quercus robur L.) referencia genomra történő térképezését végeztük el, meghatározva így azon SNP-k csoportját, amelyek kapcsolatba hozhatók a szárazsági stresszválaszban szerepet játszó folyamatokkal. A kiugró FST értékkel bíró marker lókuszok és összesen 94 klimatikus változó bevonásával végzett regresszióanalízis során 16 erősen szignifikáns kapcsolatot mutattunk ki egyes génhelyek és néhány, csapadék vagy hőmérséklet alapú környezeti változó között. A szárazság szelekció alatt álló SNP-k kimutatása számos további, a fenntartható tölgygazdálkodást megalapozó kutatás alapját képezheti a jövőben. = The genetic information concerning the adaptation of main tree species to different environmental conditions could provide considerable knowledge to determine forest management responses to climate change. In the present study, we carried out a parallel mapping of SNP markers revealed in 18 Middle- and Southeast-European sessile oak [Quercus petraea (Matt.) Liebl.] populations and EST sequences of stress-responsive loci downloaded from an EST repository to determine the group of those SNPs, which are associated with the genetic background of adaptation processes in oaks. Regression analysis revealed 16 significant correlations between four outlier SNP loci representing high FST values and 94 climatic variables. All variables with significant correlations were found to be related to precipitation or temperature. The stress-responsive loci identified in this study may serve as a basis for common research to support future sustainable management of sessile oak in Hungary.

Actions (login required)

Edit Item