Laboratóriumi paraméterek kódolása a LOINC-rendszer szerint a Debreceni Egyetem Klinikai Központjában = Coding of laboratory parameters using the LOINC system at the Clinical Center of the University of Debrecen

Rácz, Szilvia and Emri, Miklós and Opposits, Gábor and Berényi, Ervin László and Benczik, Lajos and Ludman, István Attila and Kappelmayer, János and Bhattoa Harjit, Pál (2023) Laboratóriumi paraméterek kódolása a LOINC-rendszer szerint a Debreceni Egyetem Klinikai Központjában = Coding of laboratory parameters using the LOINC system at the Clinical Center of the University of Debrecen. ORVOSI HETILAP, 164 (27). pp. 1043-1051. ISSN 0030-6002

Preview

Text 650-article-p1043.pdf - Published Version Available under License Creative Commons Attribution. Download (349kB) | Preview

Abstract

Bevezetés: A Debreceni Egyetem adatvagyonának jelentős részét alkotja a Klinikai Központban zajló betegellátás során keletkezett orvosi, biokémiai és képi adat, rendszerezetlen változatban. Ezek kutatási célú alkalmazhatósága jelentősen korlátozott. Az egyetemi „Tématerületi Kiválósági Programon” belül, a „Big Data tématerület” keretében elindított K+F projekt legfontosabb célja az anonimizált adatvagyon elérhetővé tétele a felhasználók számára megfelelő transzformációs eljárások kidolgozásával. Az elemzésre kiválóan használható adatokat az in vitro rutindiagnosztikai laboratórium által szolgáltatott adatok jelentik. A rutindiagnosztikai gyakorlatban használatos adatmezőket rövidített, magyar nyelvű, nem standardizált kulcsszavak jelölik, és e kulcsszavak kódolására a nemzetközi Logikai Megfigyelési Azonosítók, Nevek és Kódok (Logical Observation Identifiers Names and Codes – LOINC) szabvány alkalmazását határoztuk el. Referencialaboratóriumok, egészségügyi szolgáltatók, kormányhivatalok, egészségügyi biztosítók, orvosi szoftverek és műszerek gyártói, kutatók, valamint az egészségügyi rendszert igénybe vevők világszerte használják a LOINC-rendszert az adatok azonosítására, valamint azok rendszerek közötti zökkenőmentes átadására. Célkitűzés: Célunk a Debreceni Egyetem Klinikai Központjának Laboratóriumi Medicina Intézete által meghatározott rutindiagnosztikai paraméterek (n = 448) megfeleltetése a LOINC kódolási rendszernek, figyelembe véve az azonos adatok hátterében az időbeli és módszertani eltéréseket. Módszerek: A laboratóriumi adatokhoz rendelt kulcsszavakat a kórházi informatikai rendszer üzemeltetőjétől kapott adatbázis alapján elemeztük. A rutindiagnosztikában használatos kulcsszavakat, megnevezéseket használtuk a LOINC-szabvány szerinti kódolásra azután, hogy a kódolás módszertanát áttanulmányoztuk, és megfelelő jártasságra tettünk szert az alkalmazásában. Eredmények: Magyarországon egyedülálló módon megfeleltettük az elvégzett rutindiagnosztikai laboratóriumi adatok és vizsgálatok elnevezéseit a LOINC-rendszer követelményeinek, és nyilvánosan hozzáférhetővé tettük őket a Debreceni Egyetem https://labmed.unideb.hu/hu/loinc-tablazatok világhálójának elérhetőségén. Következtetés: Az egységes nemzetközi LOINC-rendszer szerint kódolt adatok hatékonyabban elősegítik a Debreceni Egyetem nemzetközi integrációs törekvéseit, többek között a laboratóriumok közötti kommunikációt, valamint a nemzetközi, határokon átívelő információáramlást és a valamennyi érdekelttel való kapcsolattartást. Orv Hetil. 2023; 164(27): 1043–1051. | Introduction: The research utility of the bulk of the medical data generated at the Clinical Center of the University of Debrecen, which is constituted mainly by the clinical diagnostic laboratory results and medical images, is quite constrained in its present unstandardized form. The primary aim of the Big Data Research and Development project at the University of Debrecen is to facilitate data transformation and standardization to propagate its research utility for the potential end-users. Data generated in the in vitro diagnostic laboratory setting are an ideal candidate for the aforementioned goals. Data generated in Hungarian language in this particular setting are typically acronyms that do not particularly confirm to any standard norms and the transformation of these data using the globally acknowledged Logical Observation Identifiers Names and Codes (LOINC) was the primary goal of this research project. Globally the LOINC is used by healthcare providers, government agencies, insurance companies, software and device manufacturers, researchers and reference laboratories for identifying medical laboratory observations and promote unhindered fluency between various systems. Objective: The aim of the project was to assure compliance of the various routine diagnostic laboratory parameters (n = 448) generated at the Department of Laboratory Medicine of the University of Debrecen to the LOINC system paying particular attention to and accommodating data sensitive to timeline and methodology. Methods: Keywords allocated to individual parameters determined by the laboratory were provided by the IT service provider of the facility. The individual codes for the various parameters were manually identified using the search engine of the LOINC database available at www.loinc.org, only upon attainment of proficiency in use of the database and ample familiarity with the scientific literature on the topic. Results: All routine diagnostic laboratory parameters were LOINC coded with no exception. The list of LOINCs’ was made available on the https://labmed.unideb.hu/hu/loinc-tablazatok web link of the University of Debrecen. Conclusion: The transformation of diagnostic laboratory parameters to globally recognized LOINCs’ improves and further facilitates the international integration of data generated at the University of Debrecen, furthermore propels communications between laboratories and parties of interest beyond international boundaries and borders.

Actions (login required)

Edit Item