Rendezetlen fehérjék nagy áteresztő képességű vizsgálata proteomikai és bioinformatikai módszerekkel

Szőllősi-Szitás, Edit and Kalmár, Lajos and Tompa, Péter (2011) Rendezetlen fehérjék nagy áteresztő képességű vizsgálata proteomikai és bioinformatikai módszerekkel. BIOKÉMIA: A MAGYAR BIOKÉMIAI EGYESÜLET FOLYÓIRATA, 35 (2). pp. 33-43. ISSN 0133-8455

Preview

Text 33_Biokemia_2011_35_2-juni_.pdf - Published Version Download (397kB) | Preview

Abstract

Jóllehet, már évtizedek óta ismert, hogy a fehérjék egyes flexibilis régiói nem rendelkeznek jól meghatározott térszerkezettel, a rendezetlenség teljes, funkcionálisan aktív fehérjékre történő kiterjesztésére csak a 80- as évektől nyílt mód, miután egyre több fehérjéről bizonyították, hogy funkcióikat épp szerkezet nélküliségük révén képesek ellátni. A rendezetlen fehérjék (RF) megismerése paradigmaváltásra késztette a fehérje biokémiát, így mára a klasszikusnak számító kulcs-zár modellt felváltotta az ún. „fehérje szentháromság”, illetve a „fehérje quartet" modell. A DISPROT adatbázisban találhatók a ma ismert, kísérletesen is bizonyított, teljes hosszukban vagy bizonyos régióban rendezetlenként azonosított fehérjék, melyek száma (~650) azonban elenyésző a jósolt rendezetlenség mértékéhez, vagy éppen a Protein Data Bank-ben (PDB) fellelhető rendezettséghez köthető 70 ezer térszerkezethez képest. Az elmúlt évtizedben a biokémia RF-kel foglalkozó ága nagy fejlődésen ment keresztül, a rendezett fehérjék megismerésére használatos módszerek közül számos kísérleti technika bizonyult valamilyen szinten használhatónak a rendezetlen fehérjék vizsgálatában. Ezzel párhuzamosan számos bioinformatikai eszközt fejlesztettek a rendezetlenség jóslására, funkcionális elemzésére. Jelen cikk a rendezetlenség egyedi vizsgálati módszerein túl képet ad a rendezetlenség nagyobb áteresztő képességű biokémiai (2D elektroforézis, MS) és bioinformatikai elemzésének lehetőségeire, rávilágítva e módszerek egymástól való függésére is.

Actions (login required)

Edit Item