Tok-herpeszvírus vizsgálata és összehasonlítása más, állategészségügyi problémákat okozó herpeszvírusokkal = Study of sturgeon herpesvirus and its comparison with other herpesviruses causing veterinary problems

Harrach, Balázs and Benkő, Mária (2010) Tok-herpeszvírus vizsgálata és összehasonlítása más, állategészségügyi problémákat okozó herpeszvírusokkal = Study of sturgeon herpesvirus and its comparison with other herpesviruses causing veterinary problems. Project Report. OTKA.

Preview

PDF 61317_ZJ1.pdf Download (715kB)

Abstract

A fehér tok-herpeszvírus (AciHV-2) genomjának középső szakaszát sikerült molekuláris klónozással és PCR-rel felerősíteni és DNS szekvenciáját megállapítani 68.700 bp hosszban (a feltételezett genomnak több mint az 50%-a). Ez 44 gén/ORF teljes és 3 gén részleges szekvenciája. Az ORF-ek nagy többsége méretében, irányultságában és lokalizációjába megegyezik vagy hasonló a foltos csatornaharcsa-herpeszvírus (IcHV-1) megfelelő ORF-jeivel. A különbségek: az IcHV-1 szerinti ORF 24 és 25 között egy plusz gént találtunk, amely feltehetően egy szerin-proteáz; az ORF 65-nek megfelelő gén hossza jelentősen nagyobb, mint az IcHV-1-ben. Olasz fekete törpeharcsából (Ameiurus melas) izolált herpeszvírusból mintegy 10.000 bázispár hosszú szakaszt erősítettünk fel PCR-rel és szekvenáltunk. A genom-szerveződés nagyfokú hasonlóságot mutat az IcHV-1-gyel. Szibériai tok-herpeszvírus genomból 11.000 bázispárt szekvenáltunk. E vírus nagyon közeli rokonságban áll az észak-amerikai izolátumunkkal. A talált filogenetikai rokonságok alapján tett vírustaxonómiai javaslatainkat részben elfogadta a Nemzetközi Vírustaxonómiai Bizottság. Ezüstkárászból elsőként mutattunk ki eddig csak aranyhalakból leírt Cyprinid herpesvirus 2-t. Hazánkban először mutattunk ki PCR-rel a pontyhimlő vírusát (CyHV-1). Összehasonlító célból eddig ismeretlen herpeszvírusokat mutattunk ki és jellemeztünk denevérekből, ázsiai kiskarmú vidrából, majmokból, egerészölyvből, melyek a Herpesviridae mindhárom alcsaládját képviselték. | The central part of the genome of white sturgeon herpesvirus (AciHV-2) was molecularly cloned or PCR amplified, DNA sequenced in 68,700 bp-length (more than 50% of the supposed genome length). This covers 44 full and 3 partial genes/ORFs. Most of the ORFs are identical with or similar to the corresponding ORFs of channel catfish herpesvirus (IcHV-1) in their size, orientation and localization. The differences: a plus gene between ORF 24 és 25 (IcHV-1 numbering) which is supposedly a serine protease; and the size of the ORF 65 homologue is considerably larger than in IcHV-1. An about 10,000 bp long genome fragment was amplified and sequenced from a herpesvirus isolated from black bullhead (Ameiurus melas). The genome organization showed high level similarity with that of IcHV-1. 11.000 bp was sequenced from the genome of a Siberian sturgeon herpesvirus. This virus is a close relative of our North American isolate. Our taxonomical proposal made on the basis of the identified phylogenetic relatedness has been partially accepted by the International Committee on Taxonomy of Viruses. We were first to detect cyprinid herpesvirus 2 in Silver Prussian carp which had been described earlier exclusively from goldfish. We detected carp pox virus (CyHV-1) by PCR first in Hungary. For comparative studies, we detected and characterized novel herpesviruses from bats, oriental small-clawed otter, monkeys, and buzzard, which represented all three subfamilies of Herpesviridae

Actions (login required)

Edit Item