A DNS talajmintából való kivonásának módszertani áttekintése

Ködöböcz, László and Murányi, Attila (2012) A DNS talajmintából való kivonásának módszertani áttekintése. Agrokémia és Talajtan, 61 (1). pp. 227-234. ISSN 0002-1873

Text agrokem.60.2012.1.16.pdf Restricted to Repository staff only until 30 June 2032. Download (184kB)

Abstract

A talajmikrobióta mélyreható vizsgálata elengedhetetlen a fenntartható mezőgazdasági termelés ökológiai alapjainak a megteremtéséhez. A mikrobiális közösségek faji és funkcionális diverzitásának vizsgálatához a rendelkezésre álló hagyományos vizsgálati eljárások mellett, szükség van a talajból történő DNS kinyerésen alapuló vizsgálati módszerek hazai agrárkutatásokba való bevezetésére. A megfelelő módszertan kidolgozásánál figyelembe kell venni a talaj fizikai és kémiai tulajdonságait, mert például a talaj pH-értéke, humusztartalma, szemcseösszetétele alapvetően meghatározza a talaj DNS kivonás sikerét. A sejtfeltárás módszerét vagy esetleg módszerkombinációit a vizsgálni kívánt mikrobacsoport(ok) anatómiai és élettani tulajdonságaihoz kell igazítani. A DNS kivonás során kompromisszumot kell találni a kinyerési hatékonyság és a tisztaság között. A kinyerési hatékonyság növelése általában a tisztaság rovására megy, vagy növeli a töredezettséget, ugyanakkor a többszörös tisztítási procedúra során kevesebb, de nagy tisztaságú DNS nyerhető, de jelentős lehet az információvesztés is. A fenti irodalmi adatok alapján a különböző módszereknek, vagy módszerkombinációknak a kutatási célhoz és az adott talaj-ökológiai körülményekhez való adaptálását és fejlesztését tartjuk szükségesnek.

Actions (login required)

Edit Item