Állati eredetű adenovírusok genetikai jellemzése az evolúciót hűen tükröző rendszertan kialakítása céljából = Genetic characterization of adenoviruses of different animal hosts to achieve an improved taxonomy, which reflects the viral evolution

Benkő, Mária and Farkas, Szilvia and Harrach, Balázs and Kovács, Gábor (2007) Állati eredetű adenovírusok genetikai jellemzése az evolúciót hűen tükröző rendszertan kialakítása céljából = Genetic characterization of adenoviruses of different animal hosts to achieve an improved taxonomy, which reflects the viral evolution. Project Report. OTKA.

Preview

PDF 43422_ZJ1.pdf Download (80kB)

Abstract

A pályázat által támogatott kutatások során rendszertani szempontból különösen jelentősnek ítélt adenovírusokat vizsgáltunk. Két óvilági majom-adenovírus teljes DNS-ének bázissorrendjét meghatároztuk és analizáltuk, mert ilyen vírusokból még nem volt ismert teljes genom. Befejezés előtt áll egy liba- és egy pulyka-adenovírus teljes szekvenciájának meghatározása is. Ezzel célunk az Aviadenovirus genusba tartozó ismert vírusok számának növelése volt. Filogenetikai számításokkal igazoljuk a madár adenovírusok gazdáikkal való koevolúciójára utaló jeleket. Egy kígyó- és egy hal-adenovírus genom elemzése az evolúciós viszonyok nagy vonalainak tisztázásához szolgáltat majd hasznos adatokat. Egy újnak bizonyult siadenovírus teljes genomanalízise folyik. A vírus, mely elhullást okozott Angliában ragadozómadár tenyészetekben a Siadenovirus nemzetség harmadik tagja lehet. Valamennyi vizsgált vírus új vírusfajt is képvisel, így elemzésük eredménye várhatóan tovább erősíti vagy cáfolja az általunk kialakított kategóriák helyességét. Az adenovírusok természetben megfigyelhető diverzitásának vizsgálatára érzékeny PCR módszert dolgoztunk ki. A PCR szűrés során pozitív, új típusnak látszó adenovírusok további vizsgálatát tervezzük. | In the framework of the project, we have studied adenoviruses that seemed to have great importance from the viewpoint of taxonomy. We determined and analyzed the nucleotide sequence of the full genome of two adenovirus isolates originating from Old World monkeys, because such viruses have not been examined before. The full genome sequencing of a goose and a turkey adenovirus, both isolated in Hungary, is almost finished. The purpose of the analysis of these avian adenoviruses was to increase the number of well-characterized members of the genus Aviadenoviruses. With phylogenetic calculations, we have confirmed that aviadenoviruses have a long co-evolutionary history with their avian hosts. Full genome analysis of a snake and a fish adenovirus will help to understand the large-scale evolutionary relations within the family Adenoviridae. Full genome sequencing of a novel siadenovirus is also in progress. The virus, that has caused mortality among captive birds of prey in England, will be only the third member in the genus Siadenovirus. Every adenovirus being studied represents a novel adenovirus species, thus criteria set for the demarcation of this taxon can also be evaluated. For the detection of biodiversity of adenoviruses circulating in the nature, a very sensitive PCR method was elaborated. We plan to further characterize those novel adenovirus candidates that are being detected during screening with PCR.

Actions (login required)

Edit Item