Víztakarékos öntözéstechnikával termeszthető rizsfajtákra jellemző génexpressziós mintázatok = Gene expression profiles characteristic to rice varieties cultivated under water-saver irrigation regime

Györgyey, János and Fónad, Péter and Kovácsné Lendvai, Ágnes and Mai, Antal and Pauk, János (2008) Víztakarékos öntözéstechnikával termeszthető rizsfajtákra jellemző génexpressziós mintázatok = Gene expression profiles characteristic to rice varieties cultivated under water-saver irrigation regime. Project Report. OTKA.

Preview

PDF 46495_ZJ1.pdf Download (2MB)

Abstract

Eltérő vízigényű rizsfajták (''szárazrizsek'' és hagyományos fajták) növekedési, termesztési paramétereit határoztuk meg árasztásos ill csak kiegészítő öntözéses körülmények között annak érdekében, hogy a korlátozott vízellátáshoz jól adaptálódó fajtákra jellemző tulajdonságokat megállapíthassuk. Kidolgoztunk egy olyan kísérleti rendszert, melyben ezeknek a fajtáknak a gyökérnövekedését vizsgálhatjuk, illetve génexpressziós vizsgálatokhoz mintát gyűjthetünk. Transzkript profilok microarray hibridizációs felvételével megállapítottuk, hogy a mélyrehatoló, erőteljes gyökérzet meghatározó jellemzője a száraz körülmények között is jól teljesítő fajtáknak, és több száz olyan gént találtunk, melynek transzkript-szintje vízellátástól függő napszakos változásokat mutat a legnagyobb tűrőképességű Sandora fajta gyökérzetében. Valósidejű kvantitatív PCR-rel ellenőriztük számos gén expressziós mintázatát, ez döntő többségében megerősítette a microarray hibridizációval kapottakat, egyúttal más aszályérzékenységű rizsfajtákban is meghatároztuk ezen gének expressziós mintázatát. | Rice cultivars featuring different water demand (upland and traditional cultivars) were studied in this project. Growth and harvest parameters of these cultivars were determined under flooding and limited sprinkle irrigation in order to find features characteristic to genotypes adapting well to water limitation. An experimental system was established that allows studies of root growth as well as collection of samples for gene expression experiments. Microarray hybridizations revealed the transcript profile of Sandora cultivar that develops strong and deep root system which is an important component of good yield performance under drought stress. Several hundred genes were found which showed water supply dependent transcript level changes in the roots of this cultivar on a daily manner. Microarray results were confirmed by quantitative real-time PCR for several genes. The expression patterns of these genes were also checked in cultivars being less drought tolerant.

Actions (login required)

Edit Item