Flow-CASA: motilitási paraméterek gyors, automatizált klaszteranalízise flow citometriás adatelemző szoftver alkalmazásával

Kovács, Barnabás Mihály and Nagy, Szabolcs Tamás (2023) Flow-CASA: motilitási paraméterek gyors, automatizált klaszteranalízise flow citometriás adatelemző szoftver alkalmazásával. ÁLLATTENYÉSZTÉS ÉS TAKARMÁNYOZÁS, 72 (1). pp. 22-28. ISSN 0230-1814

Preview

Text ATT_2023_01_2.pdf Download (1MB) | Preview

Abstract

A gazdasági állatok spermaminőség-ellenőrzésének széles körben alkalmazott eszköze a számítógépes motilitásvizsgálat (Computer-Assisted Sperm Analysis, CASA), a műszerek több évtizede elérhetők kereskedelmi forgalomban. A CASA rendszerek olyan speciális citométernek tekinthetők, amelyekkel nem fényintenzitási, hanem mozgási sebességértékeket rögzítenek, a kereskedelmi szoftverek azonban nem képesek a sejtszintű analízis végrehajtására, jellemzően csak az adott minta egyes spermium alpopulációinak arányát adják meg eredményként, ami jelentős információvesztést jelent. A szerzők előkísérletükben mélyhűtött-felolvasztott bikaspermiumok, illetve mellékheréből gyűjtött dámvad spermiumok motilitását értékelték egy kereskedelmi forgalomban elérhető CASA rendszerrel, fajspecifikus beállítások alkalmazása nélkül. A nyers adatfájlokat Excel szoftverrel rendezték táblázatba, majd txt formátumban mentve exportálták és elemezték egy flow (áramlási) citométeres adatelemző szoftverrel. A CASA által rögzített sebességértékek sejtszinten értékelhetőek, hasonlóan az áramlási citométerrel rögzített fényintenzitási értékekhez. A citométeres szoftver lehetővé teszi a sebességi paraméterek esetén is hisztogramok és kétdimenziós dot-plot ábrák vizualizációját, illetve az olyan adatelemzési eszközök alkalmazását is, mint a lin-log transzformáció, markerek és régiók kijelölése, kapuzás, különböző minták egymásra rétegezése, stb. A sejtszintű elemzés az egyes spermium alpopulációk biztosabb felismerését és a sejtélettani változások érzékenyebb észlelését teszi lehetővé. Mivel fajspecifikus műszerbeállításokra nincs szükség, a CASA-elemzések eddig nem vizsgált állatfajokra is kiterjeszthetők. A többlépcsős adatkezelés és –értékelés felhasználási lehetőségei a spermatológiai alapkutatások, reproduktív toxikológiai vizsgálatok területén kereshetők.

Actions (login required)

Edit Item