Metastabil állapotok feltérképezése a fehérjék nyomás-hőmérséklet fázisdiagramján = Exploring metastable states on the pressure-temperature phase diagram of proteins

Smeller, László and Böde, Csaba (2008) Metastabil állapotok feltérképezése a fehérjék nyomás-hőmérséklet fázisdiagramján = Exploring metastable states on the pressure-temperature phase diagram of proteins. Project Report. OTKA.

Preview

PDF 49213_ZJ1.pdf Download (158kB)

Abstract

Munkánk fő célkitűzése a fehérjék nyomás-hőmérséklet fázisdiagramjának vizsgálata, a fázisdiagram metastabil régióinak felderítése, valamint a metastabil tartományok kinetikai jellemzése volt. Az első évben meghatároztuk a tojásfehérje-lizozim, a mioglobin, apomioglobin, tormaperoxidáz és az alfa krisztallin denaturációs nyomás- és hőmérséklet-adatait. A részletes mérésekre a lizozimot szemeltük ki. A második évben megmértük a lizozim nyomásdenaturációs pontjait különböző hőmérsékleteken. Kiszámoltuk a fázisátalakulás termodinamikai paramétereit. Összehasonlításként tanulmányoztuk a tetramer hemoglobin denaturációját ill. disszociációját, valamint a két doménből álló foszfoglicerát kináz ill. a három doménes humán szérumalbumin fehérje széttekeredését is, amelynél újdonságnak számít, hogy a félretekeredett forma még a natívnál is stabilabbnak tűnik. A harmadik évben a lizozim nyomásdenaturációja utáni visszatekeredés során mértük a másodlagos szerkezet újraalakulásának és a közben formálódó aggregátumok megjelenésének kinetikáját. Megállapítottuk, hogy ezek a folyamatok nem írhatók le egyszerű kétállapotú rendszert feltételezve. Egy több kompartmentes modellt dolgoztunk ki, amelyik leírja az aggregáció többlépcsős jellegét. A kinetikai állandók nyomás- és hőmérsékletfüggéséből megállapítottuk az aktivációs térfogatot és az aktivációs energiát. Eredményeinket eddig 6 cikkben publikáltuk Ezeken kívül még két cikk van előkészületben a felsorolt kinetikai eredményekből. | The main aim of the work was the study of the pressure-temperature phase diagram of the proteins, in order to explore metastable regions on the diagram, and to characterize the kinetics of the structural changes in these metastable regions. In the first year the denaturation temperatures and pressures were detected for hen egg white lysozyme, myoglobin, apomyoglobin, horseradish peroxidase and alpha crystallin. Lysozyme was selected for further detailed study. In the second year the pressure denaturation of lysozyme was measured at different temperatures, in order to construct the phase diagram. The thermodynamic parameters of the phase transitions were determined. For comparison the pressure denaturation of the tetrameric hemoglobin, the two-domain phosphoglycerate-kinase and the three-domain human serum albumin were also measured. In the latter case an interesting feature has been found, namely that the misfolded form was more stable than the native one. In the third year we measured the kinetics of the refolding and aggregation after a pressure unfolding. These processes could not be described by a simple two-state model. A multi-compartment model was developed to describe the successive steps of the process. We calculated the activation volume and activation energy, using the pressure and temperature dependence of the kinetic constants. The results have been published in 6 articles in peer-reviewed journals. Two other papers are in preparation.

Actions (login required)

Edit Item