A magyar merinó helye a merinó fajtacsoporton belül, a genetikai hasonlóság hálózata és a napi súlygyarapodáshoz kapcsolódó markerek

Zsolnai, Attila and Egerszegi, István and Rózsa, László and Mezőszentgyörgyi, Dávid and Anton, István (2024) A magyar merinó helye a merinó fajtacsoporton belül, a genetikai hasonlóság hálózata és a napi súlygyarapodáshoz kapcsolódó markerek. ÁLLATTENYÉSZTÉS ÉS TAKARMÁNYOZÁS, 73 (1). pp. 6-19. ISSN 0230-1814

Preview

Text 01ATT_2024_01.pdf Download (1MB) | Preview

Abstract

Jelen tanulmányunkban célunk volt, hogy a magyar merinót a merinó eredetű juhfajták között pozícionáljuk, feltárjuk a fajtán belüli genetikai hasonlósági hálózat jellemzőit, és kiemeljük a napi súlygyarapodáshoz kapcsolódó egypontos genetikai polimorfizmusokat. A magyar merinót (n=138) Ovine SNP50 Bead Chip-en (Illumina, San Diego, CA) genotipizáltuk, majd 30 merinó, illetve merinóból származó fajta közé soroltuk (n=555). A populáció jellemzőit PLINK, SVS, Admixture és Treemix szoftverek alkalmazásával határoztuk meg, a fajtán belüli genetikai hálózatot python networkx 2.3 könyvtárral elemeztük. A magyar merinó napi súlygyarapodását 60 napra standardizált értékkel jellemeztük, mely a Magyar Juh- és Kecsketenyésztők Szövetsége adatbázisából állt rendelkezésünkre. A napi súlygyarapodáshoz kapcsolódó lókuszok azonosítására több lókuszos vegyes modellt alkalmaztunk. A fajta írott történetét alátámasztva a magyar merinóhoz legközelebbi fajták az estremadurai merinó és a rambouillet (francia fésűsmerinó) voltak (páronkénti Fst értékek 0,035 és 0,036). A magyar merinó esetében a páronkénti hasonlósági értékek hálózatelemzése egy erősen centralizált kapcsolódási mintázatot mutatott ki, ahol a központi csomópontban lévő állat 0,936-nak megfelelő központossági értéket mutatott. A napi súlygyarapodás vizsgálata a magyar merinóban öt kapcsolódó lókuszt tárt fel. Közülük kettő, az OAR8_17854216.1 és az s42441.1 a 8. és 9. kromoszómán (-log10p>22; téves felfedezési arány =4,1e-11) helyezkedik el. Ezek a lókuszok közel voltak a más kutatócsoportok által beszámolt markerekhez, melyek a napi súlygyarapodással, a hat hónapos súllyal és az elválasztás utáni gyarapodással voltak kapcsolatban. Meghatározásra került a magyar merinó helyzete a merinó fajtacsoporton belül. Leírtuk a mintázott egyedek hasonlósági hálóját, és meghatároztunk néhány, a magyar merinó napi súlygyarapodásának növelésére alkalmas markert.

Actions (login required)

Edit Item